STM32的系统存储区中的自举程序是否可以修改？

应该是出厂固化的，改不了

系统存储器的内容由ST生产过程中编程的，没有开发给用户修改。你既然想修改这个内容，你可以考虑自己开发用户bootloader.

手册种没有明确描述不能修改，但是也没有明确描述可以修改。

正有此意，配合开发一个上位机。

楼主可以考虑远程的IAP方法，其实IAP只是一个升级过程的办法，通过代码可以实现串口、USB、U盘、CAN等各种方式的升级。所有升级的内容的存储和升级过程其实是一样的，只是数据来源不一样，需要根据不同的数据来源来统一制定一个标准的自用格式。

这个用户没办法改吧。厂家可能有留个后门。