STM32F4 颜色传感器

各位大佬好。

刚接触单片机，现在需要实现以下逻辑：

1.发送12个周期为500ns的脉冲（高电平200ns，低电平300ns），每隔4us发送一次，共计三次（36个脉冲，每12个脉冲之间间隔4us）

2.在第一步每段12个脉冲发送的上升沿时，读取GPIO口数据，共计12个bit，三次共计36个bit。

时序图如下：

我现在处理方式如下：

开发环境：STM32F407RC，CubeMx，IAR

使用Tim1的ch1用来发送PWM（周期为500ns），同时使用Tim1来驱动DMA来读取Dout的数据，然后使用从定时器Tim3来计12次数，12次到达后进入中断，停止发送PWM和DMA，等候4us后继续，以此做三次。

问题：

周期为500ns的情况下，无法保证每次都是12次停止，9次，10次，14次等，会乱掉，周期调到us级没有问题。

如果关掉DMA，只发送PWM的话，是可以按照12次计数停止。

小弟第一次做单片机，怀疑是使用库HAL库函数对定时器有一定的影响？还是整个开发方向都是错误的。以上，希望各位大佬解惑~